Cy染料的摩尔消光系数大，吸收及发射光谱位于 600-1000纳米的近红外区，可以避免生物分子本体的荧光背景干扰，因此用于生物探针与细胞显影等领域。如Cy3、Cy5、Cy7。
相比普通可见光荧光染料，Cy系列菁染料具有更高的摩尔吸光系数，光亮度更高，光稳定性强,染料的毒性小，被应用于标记细胞以及偶联至各种抗体分子标记各类蛋白，此外由于细胞和组织在近红外的自发荧光更小，Cy系列的菁染料也非常适合做活体小鼠荧光成像的研究。
花氰染料Cyanine常被应用于生物分子标记,荧光成像及其他荧光生物分析。Sulfo Cy7-NHS ester 易溶于水，羧基由琥珀酸酯活化，在有机相/水相条件下,可以直接用于偶联氨基。
Cy系列, 也叫菁染料，即花青素系列荧光染料。它是具有多聚次甲基桥链化学结构特点的合成荧光染料。Cy染料的次甲基桥链（1-7个次甲基）两端常常连着两个氮原子，其中一个氮原子带正电，从而Cy染料形成具有离域正电荷效应的介离子化合物。因为这个结构特点，Cy染料的消光系数高。
有机荧光染料：包括花菁染料，花酰亚胺，螺吡喃，氟硼二吡咯，香豆素等。不同的荧光染料性质差异较大，例如光谱性质、溶解性、稳定性以及聚集性能等。 今天星戈瑞小编给大家分享：荧光染料的功能化的那些事？
荧光成像技术广泛地应用于生物医学研究。相比于常用的可见光以及近红外一区（NIR-I, 750-900 nm）荧光成像技术，近红外二区（NIR-II）由于发射波长（1000-1700 nm）更长，可显著降低在穿透生物组织时的光散射及自荧光效应的影响，使探测深度更深、空间分辨率更高。
随着荧光技术的发展，有机染料的荧光检测及荧光成像已经被应用于环境、生物医学等领域。其中，花菁染料具有摩尔消光系数大、荧光量子产率高，吸收及发射波长可调范围大，可修饰位点多等特点，是有机染料中研究常见的一类。
光稳定性是有机染料应用过程中需要考虑的重要问题之一。而花菁染料的共轭链长会影响影响其光稳定性及化学稳定性。
荧光探针都会包括荧光团、连接体和识别团三个部分。识别团可以选择性的与检测物结合，从而改变探针的化学环境，它决定了分子探针的选择性与特异性。荧光团是把识别团与检测物结合后，将改变的化学环境，变成我们容易看见的信息， 比如荧光产生亦或是荧光淬灭，它决定了识别的灵敏度。而连接基团则是将荧光团与识别团连接起来，进行分子识别。
Cy染料的摩尔消光系数大，吸收及发射光谱位于 600-1000纳米的近红外区，可以避免生物分子本体的荧光背景干扰，因此用于生物探针与细胞显影等领域。
