Cy5-DNA通常指在反义DNA或其他寡核苷酸链的5'端、3'端或特定位点引入Cy5荧光基团的科研材料。Cy5信号可用于核酸杂交、细胞摄取模型、凝胶成像、荧光定位、探针验证及核酸递送体系评价。具体序列、链长、修饰位点和纯化等级会直接影响实验结果,因此定制时需要明确碱基序列、标记端、修饰数量和所需纯化方式。
中文名称:花菁5标记的反义脱氧核糖核酸
英文名称:Cy5-labeled antisense DNA (Cy5-DNA)
别称:Cy5修饰的反义寡核苷酸、荧光DNA探针
反义DNA是人工合成的单链DNA,长度通常为15~25个核苷酸,能与靶标mRNA互补配对,从而抑制基因表达。Cy5染料通过共价键连接至DNA链的5'端(常用氨基修饰引物与Cy5-NHS酯反应),也可连接至3'端或内部碱基(如C5-炔基与Cy5-叠氮点击)。Cy5-DNA的荧光发射位于665~670 nm,适用于流式细胞术和共聚焦显微镜。
该材料的关键性能参数包括:
荧光标记效率:通常>80%(以260 nm和650 nm吸光度比值计算)。
稳定性:在DMSO中避光可保存1年以上;在PBS中,4℃避光可保存1个月。
热稳定性:Tm值(熔解温度)与未标记DNA相比,变化小于1℃,说明Cy5对双链形成影响微弱。
在RNA干扰实验中,Cy5-DNA可作为正义链的标记物,用于监测siRNA的细胞递送效率。例如,将Cy5-DNA与脂质体混合后转染HepG2细胞,流式细胞术显示转染阳性率可达90%以上,且荧光强度与转染试剂用量正相关。此外,该探针还可用于荧光原位杂交(FISH),检测细胞内的特定基因拷贝数。
衍生产品
衍生产品可以从荧光染料、核酸类型和功能修饰三个方向扩展。荧光染料方面可提供Cy3-DNA、Cy5.5-DNA、Cy7-DNA、FITC-DNA、FAM-DNA等;核酸类型方面可扩展至荧光标记siRNA、miRNA、mRNA片段、适配体和探针;功能修饰方面可增加Biotin、NH2、COOH、SH、Azide、Alkyne、PEG等基团,以便后续偶联或固定。
西安星戈瑞可围绕Cy5标记反义DNA提供不同序列、不同链长、不同标记位置、不同纯化等级和不同包装量的科研定制,并可配套提供荧光核酸与纳米载体、聚合物、脂质体等复合体系相关材料。具体产品信息以序列设计和检测结果为准,仅供科研使用。