CY5-COOH，CY5羧基的作用机制和应用领域
中文名：CY5羧基
英文名：CY5-COOH
激发波长：646 nm
发射波长：662 nm
介绍：
CY5-COOH是一种经典的近红外荧光染料衍生物，核心结构由花菁类母核与羧基官能团构成，分子量约为590.7 Da，外观多为深蓝色粉末状固体。作为荧光标记领域的常用试剂，其羧基基团具有良好的反应活性，可在缩合剂（如EDC、DCC）作用下与目标分子的氨基、羟基等官能团发生共价结合，实现对蛋白、多肽、核酸、小分子化合物等生物分子的特异性标记，且标记过程中对目标分子的生物活性影响较小，能很大程度保留其原有功能。
理化性质方面:
CY5-COOH具有优异的光学性能，激发波长约为646 nm，发射波长约为662 nm，处于近红外光区域，该区域的光在生物组织中穿透力强，且受生物自发荧光干扰小，可有效提升检测的灵敏度和信噪比。其在水、二甲基亚砜（DMSO）、甲醇等极性溶剂中具有一定溶解性，其中在DMSO中溶解性佳，配制储备液时通常优先选用DMSO作为溶剂，再根据实验需求用缓冲液稀释至工作浓度。此外，CY5-COOH具有较好的光稳定性，在合理的激发光强度和检测时间内，可保持稳定的荧光信号，不易发生光漂白现象，满足长时间连续观测的实验需求。
作用机制上：
CY5-COOH通过羧基与目标分子的活性基团形成酰胺键、酯键等稳定共价键，将荧光基团锚定在目标分子上，标记后的复合物可在近红外激发光照射下，使荧光基团的电子从基态跃迁至激发态，电子跃迁回基态时释放出特定波长的近红外荧光，通过荧光显微镜、流式细胞仪、荧光分光光度计等设备可捕获该荧光信号，从而实现对目标分子的定位、定量分析及追踪。
应用领域广泛：
涵盖生物医学研究、临床诊断辅助、药物研发等多个方向。在细胞生物学研究中，可用于标记抗体、抗原，实现细胞表面抗原的定位检测、免疫荧光染色等实验；在分子生物学领域，可标记核酸探针，用于核酸杂交、基因定位、实时荧光定量PCR等实验，助力基因表达分析；在药物研发中，可标记药物分子，追踪药物在生物体内的吸收、分布、代谢、排泄过程，为药物靶向性评估提供依据；此外，还可用于组织成像、活体成像等研究，在肿瘤早期诊断、病理切片分析等场景中发挥重要作用。
使用方法需严格遵循实验规范，首先将CY5-COOH粉末用无水DMSO溶解，配制浓度为1-10 mM的储备液，分装后置于-20℃避光保存，避免反复冻融影响荧光性能。标记反应时，根据目标分子的浓度和反应体系，加入适量储备液，同时加入缩合剂和催化剂（如NHS），调节反应体系pH至7.0-8.5，在室温或4℃下避光孵育1-4小时。反应结束后，通过透析、凝胶过滤层析、超滤等方法纯化产物，去除未结合的游离染料，避免干扰实验结果。使用过程中需注意避光操作，激发光强度不宜过高，防止荧光淬灭；同时做好个人防护，避免试剂接触皮肤和黏膜，实验废弃物需按化学危险品规范处理。
注意事项方面，CY5-COOH对光和温度敏感，长期储存需置于-20℃避光环境，可加入抗氧化剂防止氧化降解；储备液避免反复冻融，建议分装为小体积使用；标记反应时需控制染料与目标分子的摩尔比，过量染料可能导致非特异性结合，影响实验准确性；不同缓冲液对荧光信号可能存在影响，建议选用pH稳定、无荧光干扰的缓冲体系（如PBS缓冲液）。
以上数据均来自文献/科研资料,星戈瑞暂未进行独立验证,限参考。我方仅提供相关产品，不参与保证任何实验，具体应用还需参考相关实验设计及文章！(以上文中所述仅限于科研实验及实验室环境)
