CY5.5-COOH
CY5.5-COOH 是一种在分子结构上以羧基修饰的花青素类荧光染料，其英文全称为 Cyanine5.5-carboxylic acid，常简写为 Cy5.5-COOH 或 Cyanine5.5-COOH。它属于长波段荧光染料，发射波长约在 695–710 nm 之间，激发波长约 675 nm，具有强荧光信号和优良的光稳定性，因此在科研、分析和材料领域中具有广泛应用价值。
一、结构与化学性质
CY5.5-COOH 是花青素类染料 Cy5 系列的衍生物，其核心为 共轭的多亚甲基链结构，两端通常通过苯环或吡啶环稳定。相较于普通的 Cy5，Cy5.5 的共轭系统更长，导致其发射光谱红移至近红外区域，从而减少光散射和背景干扰。
羧基 (-COOH) 的引入，使 CY5.5-COOH 在化学上具备以下特点：
水溶性增强：羧基可与水分子形成氢键，提高染料在极性溶剂中的溶解度。
易于共价偶联：羧基可通过酰胺键与胺类、羟基或其他功能化分子反应，实现分子标记或功能化修饰。
稳定性较好：在常温、弱酸性至中性溶液中具有较好的光化学稳定性，但在强碱或强氧化剂环境下可能发生光解或结构降解。
此外，CY5.5-COOH 的荧光量子产率较高，在有机溶剂及缓冲液中均表现出强烈的红外荧光，其极化率和光学可调性使其在分子成像和光学传感中表现出优异性能。
二、主要应用领域
荧光标记与探针构建
CY5.5-COOH 常用于与生物大分子（如蛋白质、多肽、核酸）偶联，制备荧光探针。通过羧基与胺类分子的共价结合，可实现稳定的分子标记，适用于分子检测、荧光成像以及分子动力学研究。
材料科学与纳米材料修饰
羧基的存在使 CY5.5-COOH 可与纳米颗粒、聚合物或脂质体等载体表面进行化学修饰。通过这种方式，染料不仅保持其光学特性，还能够赋予材料可追踪性，实现对微观体系的荧光监控。
近红外荧光成像与传感
由于 CY5.5-COOH 发射光谱处于近红外区（NIR），其荧光信号在光学背景噪声低的环境下更容易被检测，因此在光学传感、微流控体系检测以及荧光成像实验中广受青睐。其高灵敏度和低背景特性适用于检测微量分子或追踪动态过程。
光学研究与多重标记实验
在实验室中，CY5.5-COOH 可与其他荧光染料联合使用，实现多重标记和多通道成像。其发射波长与常规可见光染料分离度高，有效避免了信号重叠和干扰。
三、使用与储存注意事项
溶解性：CY5.5-COOH 可溶于 DMSO、DMF 等极性有机溶剂，水溶性较低，可通过钠盐化提高水溶性。
光稳定性：应避光保存，推荐在低温（4°C 或 -20°C）干燥环境中长期储存。
反应条件：进行共价偶联时，通常需使用水溶性偶联试剂（如EDC/NHS），反应环境应控制在中性至微酸性，避免染料自体降解。
安全性：CY5.5-COOH 为化学品，操作时需佩戴手套和护目镜，避免直接吸入粉末或液体接触皮肤。
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