CY5-NH2作为近红外荧光标记物，在科研的荧光成像和检测中应用诸多。其核心优势在于 ~670 nm 的发射波长，该波段处于近红外一区，具有组织穿透性好、生物样本自发荧光背景低、光损伤小等特点。
成像与检测技术
荧光显微镜成像：
应用：细胞定位（细胞膜、细胞器、胞内蛋白）、组织切片（病理分析、蛋白表达分布）、细胞相互作用（如免疫突触）、活细胞动态过程（需低光毒性染料）。
技术相关：
光源：需要配备 ~633 nm 或 640 nm 激发激光器（共聚焦显微镜）或相应波段的滤光片组（荧光倒置显微镜）。
检测器：配备能检测 >650 nm (通常 660-710 nm) 发射光的高灵敏度探测器。
样品：通常是将 CY5-NH标记的抗体、核酸探针、配体等与细胞或组织切片孵育，进行固定、透化（胞内标记）、封片后观察。
优势：高分辨率、可进行多色标记（与 FITC、TRITC、DAPI 等可见光染料组合，避免光谱串扰）、共聚焦可进行光学切片。
注意事项：严格避光操作和保存样品；优化标记浓度和孵育条件以减少非特异性结合；注意光漂白，使用抗淬灭封片剂。
流式细胞术：
应用：细胞表面/胞内标志物检测与分群、细胞周期、细胞凋亡、细胞功能分析（如钙流）、高通量筛选。
技术相关：
激光器：通常使用 ~633 nm 或 640 nm 红色激光器。
检测通道：配置检测长波长荧光。
样品：细胞悬液经CY5-NH2标记的抗体或其他探针染色后上机分析。
优势：高通量、单细胞水平定量分析、多参数分析（可与 FITC, PE, APC 等染料联用，光谱分离好）。
注意事项：优化抗体/染料用量；设置好补偿（尤其与其他红色通道染料如 APC 联用时）；注意死细胞可能产生非特异性荧光；严格避光操作。
小动物活体成像：
应用：生长与转移示踪、药物靶向性与分布研究、干细胞/免疫细胞追踪、基因表达活体监测、血管生成、炎症反应等。
技术相关：
成像系统：专门的近红外小动物活体成像系统。
激发/发射滤光片：选择匹配 CY5 激发峰（~640-650 nm）和发射峰（~670 nm）的滤光片组。
样品：将CY5-NH2标记的抗体、多肽、纳米颗粒、适配体、小分子药物或标记好的细胞注射到动物体内，在不同时间点进行全身或局部成像。
优势：非侵入性、可实时动态观察、全身扫描、组织穿透深度相对可见光染料有提高（毫米级）。
注意事项：仅浅表，更深的活体成像考虑CY5.5以及CY7。选择生物分布和代谢特性合适的标记物；优化给药剂量和成像时间点；麻醉稳定；注意背景荧光（如食物、毛发）。
体外检测：
应用：
Western Blot: 标记二抗，进行蛋白条带检测。灵敏度高，动态范围宽，可多重检测（与 IRDye 800 等更远红外染料联用）。
ELISA/免疫检测：标记检测抗体或链霉亲和素（用于生物素化的检测体系），进行微孔板检测。
微阵列/芯片：标记核酸探针或蛋白，用于基因表达谱分析、SNP 检测、蛋白相互作用研究等。
凝胶电泳：预染标记蛋白或核酸，在电泳过程中实时观察条带迁移。
技术相关：
检测设备：激光扫描成像仪（如 Typhoon, Odyssey - 选择 670 nm 通道）、荧光酶标仪（配备 ~635 nm 激发和 ~670 nm 发射滤光片）、荧光凝胶成像系统。
优势（WB/芯片等）：灵敏度高（常优于化学发光法）、线性范围宽、定量更准确、可多重检测、无需底物显色更稳定。
注意事项：标记效率影响信号强度；严格避光操作膜、凝胶或微孔板；优化封闭和洗涤步骤减少背景。
CY5-NH2用于成像/检测特点
近红外窗口：避开生物组织主要吸收和散射区域，穿透更深，背景荧光极低，提高信噪比。
高亮度：摩尔消光系数高，量子产率相对较好，提供强荧光信号。
光谱兼容性：激发和发射波长与常用可见光染料（FITC, TRITC, Cy3）及远红外染料（Cy7, IRDye 800）有良好分离，非常适合多重标记和检测。
相对良好的光稳定性：比许多可见光染料更耐光漂白，适合需要长时间观察的成像实验。
【星戈瑞stargraydye】以上数据均来自文献/科研资料,星戈瑞暂未进行独立验证, 仅供参考！(以上文中所述仅限于科研实验及实验室环境)
