Cy3-TCO是一种将花菁染料Cy3与反式环辛烯（Trans-Cyclooctene, TCO）基团偶联形成的荧光标记分子
CY5-PAMAM是通过将花菁染料CY5标记在聚酰胺-聚酰胺-胺型树枝状聚合物（PAMAM）的分子上而形成的化合物。
Cy5.5-Sodium Deoxycholate作为一种荧光标记分子，可以广泛用于细胞和组织的荧光成像。由于Cy5.5的近红外荧光特性，能够在体内深层组织中实现较好的成像效果，减少了传统紫外可见光激发染料带来的穿透性问题。
CY5.5-Antioxidase是一种将近红外花菁染料Cy5.5与抗氧化酶（Antioxidase）通过共价偶联方式结合形成的功能性荧光标记复合物
CY5.5-Avidin是一种将近红外花菁染料Cy5.5与亲和素（Avidin）通过共价偶联方式结合而成的功能性荧光标记复合物。
Cy5.5-Ce6是一种将近红外花菁染料Cy5.5与二氢卟吩（Chlorin e6，Ce6）通过化学偶联方式构建的双功能荧光标记分子。
Cy5.5-biotin是一种将近红外花菁染料Cy5.5与生物素（Biotin）通过化学连接方式构建而成的荧光标记分子探针。
CY5.5-Ficoll是一种将近红外花菁染料CY5.5与聚蔗糖（Ficoll）通过共价或稳定复合方式结合形成的荧光标记高分子材料。
CY5.5-GDCA是一种将近红外花菁染料CY5.5与甘氨脱氧胆酸（GDCA）通过共价方式结合得到的功能性分子探针。
CY5.5-HA是一种将近红外花菁染料CY5.5与透明质酸（Hyaluronic Acid, HA）通过共价键合方式结合形成的功能化荧光标记多糖材料。
