花青素CY5-棉子糖为固态粉末或溶液形式，易溶于水及部分有机溶剂（如DMSO、DMF）。其分子量通常根据所用CY5和棉子糖的具体衍生物而变化，化学稳定性良好，不易氧化。
CY5-HSA，即CY5标记人血清白蛋白，是一种将荧光染料Cyanine5（CY5）与人血清白蛋白（Human Serum Albumin, HSA）通过化学偶联形成的荧光标记蛋白复合物。
CY5-Cisplatin 是一种将传统金属配合物 顺铂（Cisplatin, cis-diamminedichloroplatinum(II)） 与 荧光染料 CY5（Cyanine 5） 共价结合形成的复合分子。
CY5-Dextran 是一种将天然多糖 葡聚糖（Dextran） 与 氰基荧光染料 CY5（Cyanine 5） 共价标记形成的荧光分子复合物。
CY3-Taurine 是一种由 牛磺酸（Taurine, 2-aminoethanesulfonic acid） 与 荧光染料 CY3（Cyanine 3） 共价连接而形成的荧光标记分子。
CY5.5-COOH 是一种在分子结构上以羧基修饰的花青素类荧光染料，其英文全称为 Cyanine5.5-carboxylic acid，常简写为 Cy5.5-COOH 或 Cyanine5.5-COOH。
CY5.5-Alkyne作为标记分子，在生物成像中应用广泛。其发射光谱位于近红外区域（通常在750 nm附近），使其在生物体内成像时具有较低的背景干扰，尤其适用于体内成像和长时间跟踪
CY5-异紫花前胡内酯（CY5-Marmesin）是一种功能性荧光标记化合物，由红色荧光染料CY5与天然有机分子异紫花前胡内酯（Marmesin）通过共价偶联形成。
水溶性-CY5.5-炔基（Sulfo-CY5.5-Alkye）是一种高性能的水溶性荧光染料衍生物，由红外荧光染料CY5.5通过末端炔基（–C≡CH）修饰而成，并引入磺酸基以提高其在水相环境中的溶解度。
Cy3-6-N3 是一种以 Cy3 花菁染料为基础的功能化衍生物。Cy3（Cyanine 3）属于花菁染料家族，是典型的共轭多烯结构染料，由两个吡啶环通过共轭链相连，形成高度共轭的 π 电子体系。
