Cyanine3 tetrazine 是一种带有四嗪部分的荧光染料，用于称为 TCO（反式环辛烯）连接的偶联反应。实际上，四嗪不仅与反式环辛烯反应，而且与（甲基）环丙烯和应变的非苯并稠合环炔反应。Cyanine3 是一种中等疏水性染料，能够在非水环境以及含有一些有机助溶剂（如乙腈或 DMSO）的水介质中进行标记。对于在纯水介质中的反应，可以使用该试剂的磺化形式。
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硅基罗丹明SIR（silicon rhodamine）染料是一种深红色近红外荧光染料、细胞渗透性强、高特异性的DNA探针。具有优异光物理性质、良好的生物相容性，在保留了罗丹明荧光染料优越的光学性质的同时，光谱发生明显红移，满足了近红外荧光检测的要求，其激发波通常长大于600 nm，发射波长位于近红外区约680 nm。
FAM（fluorescein）羧基荧光素是一种比较古老的通用荧光染料，可用于显微镜、qPCR和许多其他方法，以及基于FRET和基于荧光偏振的结合分析。
磺化Cy3是Cy3(Cyanine 3)的水溶型。它的光谱性质和Cy3类似，在荧光显微镜下发橘黄色荧光。
SiR 荧光染料 (硅罗丹明荧光染料) 是一种可轻松穿透细胞膜进入细胞，并且荧光亮度和稳定性都非常好的荧光染料。
FITC是一种黄色粉末状的荧光染料，激发波长为494 nm左右，具有高吸收率、优良的荧光量子产率和良好的水溶性等特点，是生物学中应用最为广泛的一种绿色荧光素衍生物
Sulfo CY3-COOH是水溶性磺基花青3染料，非活性、单功能团的羧基染料，可用作Cy3检测通道的参比荧光团
CY3-MAL可用于将Cyanine3荧光团（Cy3）连接到含有半胱氨酸残基的蛋白质和肽以及其他硫醇化分子（例如含硫醇的寡核苷酸）上。
Cyanine3 NHS酯是一种活性染料，用于标记生物分子中的氨基，是Cy3的衍生物。该试剂是标记可溶性蛋白质、肽和寡核苷酸/DNA 的理想选择。
