异硫氰酸荧光素(FITC)就是荧光素类染料的其中一种，发射波长为520 nm，是目前最常用的荧光标志物；可以与-OH、-COOH、-NH2 -N3等常见基团结合，用来标记缺少易于检测的的发光基团的多糖，以供开展对多糖的检测和追踪。
荧光素是常见的荧光染料之一。其与强碱反应生成荧光素盐，易溶于水，并有强烈绿色荧光，荧光量子产率0.65（pH=7水溶液），可使许多生物具有荧光的物质。它与ATP形成复合物（荧光素腺苷），然后再与荧光素酶(Luciferase)结合。
Cy3-alkyne Cy3-alk CAS：1902918-31-3 花菁染料CY3标记炔烃 近红外染料CY3标记炔烃 CY3炔基染料 花氰染料Cy3炔烃 脂溶性Cy3-alkyne
Sulfo-Cyanine3 azide Sulfo-Cy3 azide 磺基花青3叠氮化物; Sulfo-Cy3-N3 磺酸基-Cy3-N3 磺酸化CY3叠氮； 水溶性Cyanine3叠氮 硫代-青色素3叠氮 水溶性染料叠氮化物
Cy3-maleimide CAS：1838643-41-6 CY3-MAL 荧光染料CY3标记马来酰亚胺 花菁染料CY3标记马来酰亚胺 近红外染料CY3标记马来酰亚胺 Cy3马来酰亚胺酯黄光活性染料
Sulfo-CY3 maleimide马来酰亚胺，磺基-Sulfo-CY3-N-马来酰亚胺，Sulfo-CY3马来酰亚胺，水溶性染料马来酰亚胺，Sulfo-Cyanine3 MAL，CAS1656990-68-9，Sulfo-CY3 MAL，水溶性Sulfo-CY3 MAL，硫代-青色素7马来酰亚胺，磺酸化Sulfo-CY3马来酰亚胺
荧光染料是指吸收某一波长的光波后能发射出另一波长大于吸收光的光波的物质。它们大多是含有苯环或杂环并带有共轭双键的化合物。可以单独使用，也可组合成复合荧光染料使用。 有机荧光材料在生物成像方面是种应用性很强的发光材料，可广泛应用于荧光免疫，荧光探针，细胞染色等。包括特异性DNA染色、标记蛋白质、活体成像和环境检测等领域研究。
BODIPY 的光谱峰宽比较窄，使得染料具有非常高的灵敏度，即使待测样品溶度低也可以表现出显著的荧光变化，对光的感应度很高，荧光染料的光稳定性能非常优越，分子的荧光量子产率非常高，一般都能达到0.6。正因为氟化硼二吡咯（BODIPY）类荧光染料上述的这些优点，所以该染料非常适用于荧光光谱分析以及生物标记检测领域.
花菁染料的物质CY3、CY5均是常用于分子标记的荧光标记试剂，此类物质由于荧光强度高、稳定性强，用于蛋白、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。
目前常用的为可见光区（400-700 nm）和近红外一区（NIR-I，700-900 nm）的荧光染料。相较于可见光区和近红外一区荧光，近红外二区（NIR-II，1000-1700 nm）荧光在机体的散射和组织吸收变少，此波段的生物自荧光效应极低，在体内成像中展现出深的组织穿透深度和高的空间分辨率等。
