2,6-二碘-四甲基BODIPY，由于重原子效应，其荧光被猝灭，但是其光稳定性远远高于罗丹明B,是一种有效的光敏剂。
Cy3 (Cyanine3) 是一种花菁染料，也是一个发橙红色荧光的标记物。脂溶CY3水溶性较低，在水相标记反应时常常需要使用有机共溶剂，常用有机溶剂包括DMF，DMSO和乙腈等。
磺基-花青7是一种近红外荧光团，具有亲水性，在其七甲醛链中含有一个刚性环，可改善其光物理性能。
荧光多肽的应用范围从多肽到蛋白质相互作用的研究，酶活性测定，或开发新的疾病模型。荧光团可以共价连接到N端或c端，但建议结合到N端。
花菁染料，也叫CY（Cyanine）染料是一种常见的荧光化合物，也是一种多甲川染料的衍生物。
水溶性花菁染料CY5标记马来酰亚胺是具有亲水性的，用于蛋白质标记和抗体标记。
七甲川花菁染料标记马来酰亚胺可将近红外花菁7染料附着到具有游离巯基的蛋白质上。
氰基5马来酰亚胺是一种单活性染料，其选择性地与硫醇基团（例如，与肽和蛋白质中的半胱氨酸）偶联，以产生标记的偶联物。
Sulfo-Cyanine3 maleimide水溶性硫醇反应性黄色发光染料。
