荧光素(FAM)是比较古老的荧光染料之一。FAM的这种衍生物含有环辛炔基团(二苯并环辛炔，缩写为DBCO或ADIBO)，可以通过无铜、菌种促进的叠氮炔环加成(spAAc)与叠氮结合。
花菁3（Cy3）染料可用于标记生物分子，用于荧光成像和其他基于荧光的生化分析，可标记肽，蛋白质和寡核苷酸等。
Cy3 (Cyanine 3) 是一种发光的花青素染料，它发红色荧光，对pH不敏感，并且处在肉眼较敏感的可见光区，在绝大多数荧光仪器上都可使用。
花菁染料是一种发红色荧光的荧光染料，其可用来标记蛋白、抗体、多肽、核苷酸分子等，常用于生物成像、细胞检测
ICG（Indocyanine Green），吲哚菁绿CAS:3599-32-4是一种三碳菁染料，具有良好的水溶性，分子量为775，激发波长：780nm左右，发射波长：800nm左右。
菁染料是一种能使感光材料增加感光性的染料，常见的有多甲川花菁染料（CY）和吲哚菁绿（ICG）。
吲哚菁绿标记骨涎蛋白ICG-BSP,吲哚菁绿标记前白蛋白ICG-PAB
Sulfo-Cyanine3 maleimide水溶性硫醇反应性黄色发光染料。可用于在轻度纯水性条件下标记抗体和其他不稳定蛋白质。染料是水溶性的，不需要使用有机助溶剂。
Cy3 (Cyanine3) 是一个传统的蛋白质和核酸的橙红色荧光标记物。Cy3一般偏脂溶性，水溶性较低，在水相标记反应时常常需要使用有机共溶剂，常用有机溶剂包括DMF，DMSO和乙腈等。
吲哚菁绿ICG（CAS：3599-32-4）是一种带负电荷的聚甲炔染料。ICG能用于几种标记蛋白的分离，包括人血清白蛋白、核酸酶A、转铁蛋白和细胞色素C。
